Il manganese fa parte di numerosi enzimi molto importanti ed è dunque un elemento essenziale per l'organismo. Il manganese è presente nell'arginasi (sintesi dell'urea), nella piruvatocarbossilasi (gluconeogenesi), superossidodismutasi, citocromossidasi, glicosiltransferasi, colinesterasi, iso-citratodeidrogenasi, e nella sintesi del mucopolisaccaridi.
Il mangenese interviene anche nei processi di biosintesi del colesterolo, nel metabolismo delle catecolamine (importanti ormoni) e delle ammine biogene.
Il manganese è contenuto in moltissimi alimenti di uso comune, dunque sono molto rasi i casi di carenza, mentre gli eccessi si riscontrano solamente per avvelenamento causato dalla frequentazione di ambienti inquinati da manganese, come le miniere o alcune industrie.
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